Jest to dodatkowy argument uzasadniający wdrożenie profilaktyki za pomocą szczepień. Zalecenia te dotyczą jednak wszystkich niemowląt, ponieważ w tej grupie wiekowej obserwuje się większą zapadalność na inwazyjną chorobę meningokokową (IChM). Wprawdzie zachorowania na IChM występują we wszystkich grupach wiekowych, jednak według danych Krajowego Ośrodka Referencyjnego ds. Diagnostyki Bakteryjnych Zakażeń Ośrodkowego Układu Nerwowego (KOROUN) największa zapadalność dotyczy dzieci <5. roku życia, a zwłaszcza <12. miesiąca życia (p. W których grupach wiekowych obserwuje się największą zapadalność na IChM i jakie grupy serologiczne meningokoków dominują w Polsce?). Choć w tej grupie wiekowej przeważają zakażenia wywoływane przez meningokoki należące do grupy serologicznej B, to obserwuje się również zachorowania wywoływane przez meningokoki grupy C, co uzasadnia szczepienia za pomocą obu dostępnych szczepionek zarejestrowanych dla niemowląt. Alternatywną szczepionką w stosunku do MenC może być skoniugowana 4-walentna szczepionka przeciwko meningokokom grupy A, C, W-135 i Y (MCV-4), którą można szczepić niemowlęta między 6. a 12. tygodniem życia. Zastosowanie profilaktyki wobec typów serologicznych A, C, W i Y uzasadnione jest występowaniem pojedynczych zachorowań wywoływanych przez serogrupy W i Y u dzieci w 1. roku życia.