Jak tłumaczy Ministerstwo Zdrowia, ponad czteroletni okres obowiązywania dotychczasowego rozporzadzenia wykazał, że wiele przepisów wymaga uszczegółowienia i modyfikacji z uwagi na zmiany organizacyjne, strukturalne i własnościowe jednostek organizacyjnych publicznej i niepublicznej opieki zdrowotnej.
Konieczne było również uaktualnienie procedur dotyczących zabezpieczenia medycznego przedsięwzięć związanych z uczestnictwem w strukturach NATO i UE.