Treść rozporządzenia w znaczący sposób odbiega od propozycji zawartych w projekcie tego aktu prawnego przekazanego do konsultacji społecznych. Projekt składał się z 94 stron i zawierał rozwiązania w zasadniczy sposób zmieniające system specjalizowania lekarzy w Polsce. W podpisanym rozporządzeniu nie znalazły one miejsca, a nowelizacja zawiera jedynie dwa punkty dotyczące Państwowego Egzaminu Specjalizacyjnego.