7 milionów złotych jest winien Narodowy Fundusz Zdrowia Zakładowi Opieki Zdrowotnej Ministerstwa Spraw Wewnętrznych i Administracji z Warmińsko–Mazurskim Centrum Onkologii w Olsztynie za za badania i zabiegi wykonane ponad limit w 2006 roku. Spór szpitala z Funduszem toczy się od półtora roku i nie wiadomo, kiedy dojdzie do ugody.
NFZ po kontroli szpitalnej dokumentacji zakwestionował część usług wykonanych na kwotę 48 000 zł i polecił, aby sprawę zbadała prokuratura. Kwota ta blokuje wypłatę pozostałych 6,95 mln zł. Teraz prokurator zdecyduje, ile pieniędzy za wykonane "nadlimity" dostanie poliklinika MSWiA. Postępowanie ma się zakończyć w maju.