Oddział jest wyposażony w 6 stanowisk do monitorowania stanu dzieci po operacjach. Dla rodziców zakupiono rozkładane fotele oraz zbudowano kuchnię i łazienkę. Gdańska kardiochirurgia dziecięca jest 4. oddziałem w Polsce, któremu nadano imię WOŚP.
Oddział udało się stworzyć dzięki finansowemu wsparciu Urzędu Marszałkowskiego (2,5 mln zł), Fundacji Polsat (1,5 mln zł) oraz wielu mniejszych sponsorów. Przede wszystkim jednak oddział swoje powstanie zawdzięcza lekarzom.