W opinii PKPP, projekt ustawy utrzymuje dotychczasowy system finansowania konsultantów, który można nazwać systemem ryczałtowym. "Przypomina on finansowanie za gotowość pozostawania do dyspozycji ministra zdrowia, a także innych podmiotów zarówno publicznych, jak i niepublicznych, które mogą domagać się wydania od konsultantów różnego rodzaju opinii lub informacji" - głosi stanowisko Konfederacji. Zdaniem PKPP, system ten powinien zostać zmieniony w celu lepszego wykorzystania środków publicznych.